背景图简介

勾勒人身体聚集的表观遗传表达出图谱常异常于更健康子样表的提取。过去理论研究多选取脑死掉捐献器官者或病理学去除聚集旁的"挨近很正常"聚集，但此类子样表来源于血管痉挛、分解代谢失调或的疾病微条件干涉等故障 。

2026年4月，国际顶级期刊《Nature》发表了题为“A spatial atlas of the healthy human liver from live donors”的突破性研究，该研究通过环境空间转录组学（Visium、Visium HD、MERFISH和PhenoCycler 成像）与单神经元核RNA测序（snRNA-seq）的深度整合，系统揭示了活体健康人肝的空间表达蓝图，并发现人类肝脏中央区功能相较于小鼠及其他哺乳动物存在明显差异。本研究为健康人类肝脏提供了空间基因表达参考框架，并深入揭示了早期脂肪变性过程中肝细胞的变化机制。

地方转录组学

阐述活体身体供肝的显著转录组特殊性

研究团队首先通过Visium房间转录组学系统解析了16例肝脏样本的转录组特征，包括8例活体健康供肝（LHD）和8例病理旁"邻近正常"组织。在44,243个高质量spots中，研究发现活体健康供肝与邻近正常组织在伪批量表达谱上明显分离：健康供肝高表达肝细胞功能基因，包括尿素循环酶（ASS1）、药物代谢酶（CYP2E1）和糖异生基因（PCK2）；而邻近正常组织则高表达免疫相关基因（S100A8、S100A9）和应激基因。线性混合回归模型显示，"样板品类"是人类基因表明进化的主要是驱动器元素，其效应超过年龄、性别和组织学评分。这一发现警示：传统病理旁"正常"组织可能存在系统性偏差，活体健康供肝才是建立真正健康参考标准的理想选择。

图1 物种进化和母乳喂养两栖动物肾脏器官的空间表达出来图谱

Visium HD & MERFISH

构建肝小叶门门静脉

中共中央静脉血管轴的协调分离图谱

利用CYP2E1等标志基因构建分区指数，研究团队将肝小叶划分为9个层面。在1,724个肝细胞特异性基因中，1,148个（66%）体现出相关系数的系统分割差异性。中央静脉区富集外源物质代谢（CYP2E1）、胆汁酸合成（CYP27A1）和脂质合成（FASN）基因；而门静脉区则高表达免疫相关基因（CRP、SAA1）和经典糖异生基因（PCK1）。的提升性表明：人类特有的线粒体糖异生基因PCK2和葡萄糖转运蛋白GLUT2（SLC2A2）均呈中央静脉区富集，间接挑战赛了传统型看做糖异生限于门静脉血管区的的观点。Visium HD与Visium数据验证这些分区模式（Spearman R=0.70，P<10⁻³⁰），MERFISH在500个基因上进一步独立验证了分区模式。

图2 肝神经元DNA呈现区域

跨种群空间区域转录组学

体现人肝设计布局传统模式的种类非特异朋友

研究团队生成小鼠（n=6）、野猪（n=2）、家猪（n=3）和牛（n=2）的空间转录组数据，进行系统比较。主要结论：人与小鼠的分区偏倚相关性较低（R=0.15，P=5.18×10⁻²⁵），存在大规模功能偏移。人类中央静脉区显著富集尿素循环酶（OTC、ASL、NAGS）、脂肪酸合成酶（FASN）及转录因子HNF4A（在小鼠中为门静脉区富集），而这些功能基因在小鼠中多呈门静脉区富集。更意外的是，与猪、牛等大型哺乳动物相比，人肝中央静脉区功能多样性仍显著更高。无论怎样WNT无线信号信号通路的设计布局形式在一切鱼类中单纯，但人類中间区功用的特点摆动也许由分泌率、的激素均值等鱼类特情人基本要素驱动下载，提示小鼠模型在研究人肝脏代谢疾病时可能存在系统性局限。

图3 蒲乳期甲壳动物之間奇特和一同的划分经营模式

snRNA-seq & Visium HD

剖析非实质性细胞核的室内空间系统分割及互作网咯

通过snRNA-seq（67,000+个血细胞质）结合Visium HD空间定位，研究团队构建了成纤维细胞、Kupffer细胞、肝窦内皮细胞等非实质细胞的分区图谱。与小鼠多种，人肝Kupffer神经细胞呈中间区丰度，可能与其清除高代谢活性中央区死亡肝细胞的功能相关。进一步分析发现多个分区特异性配体-受体互作对：中央区LSECs来源的WNT2与肝细胞FZD5及成纤维细胞FZD1受体互作；成纤维细胞和LSECs表达的RSPO3与肝细胞LGR5和LGR4受体共分区。这些结果为理解肝内分区特异性信号通讯提供了重要资源。

图4 肝脏等非实际神经元的系统分割

系统学会&多个学资源优化配置

阐明前期碳水化合物退行中的线粒体代偿政治危机

在表现为轻度脂肪变性（<20%）的健康供肝中，MASLD 脂质积累起始于中央静脉区。研究团队利用机械深造对H&E形象做好手机像素级脂滴一定量，将中央静脉区spots按脂质含量分为5个梯度。结果显示：随着脂质增加，脂质摄取/合成基因（SLC27A3、DGAT1）下调，而β-氧化（DIO1、HSD17B4）和脂质分泌（ABCB4）基因上调——提示肝细胞试图通过增强线粒体氧化能力限制脂质堆积。关键提示：核编码线粒体蛋白基因（如NDUFA9、NDUFS4、NDUFS8）表达下降，而线粒体自身编码的RNA（MT-ND1、MT-ND4L）却代偿性上升。这种核-线粒体基因表达失衡可能是未来脂毒性的潜在机制之一，为MASLD（代谢相关脂肪性肝病）早期干预提供了全新靶点。

图5 脂肪含量变形肝上皮细胞基因组理解的情况变换

拜谱工作小结

本研究方案成功的勾勒了从"子样本提取→三维空间图谱→跨鱼类较为→上皮细胞互作→皮肤疾病体制"的详细探讨链轮，根据多个学高技术击碎了"良好剖析也可以病理报告旁组识重复使用"的普通社会认知，内容中第一次厘清活体良好供肝算作"团伙规范标淮"的重点的地位，为表达肝或其他排毒器官系统盘的功能的鱼类活性朋友提供数据了范式。拜谱怪物创立时间与空间多个学深入分析服务于，可观赏"前景异质性-癌细胞互作-妇科疾病机能"关联关系深入分析的重要各种需求，进行两组学论文检测、深层网络覆盖：的空间转录组（Visium/Visium HD）、单内部测序（scRNA-seq/snRNA-seq）、靶点代谢率组及核蛋白组学的全设计应对设计，展示 从检验到分享的全设计服务的，机械助力中医药学研究分析踏入新时候。感谢咨讯！

参考选取学术论文

Yakubovsky O, et al. A spatial atlas of the healthy human liver from live donors, Nature (2026), //doi.org/10.1038/s41586-026-10377-y