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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

长期当做化工新材料原材料而被遵守的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“基础代谢废料”加入“宝箱小原子”的苦不堪言之路类似的,终会近十多年才被发觉其必要的生物技术学能力,此后“侧睡农奴把合唱”,十分是在抗体细菌感染性症状探究各个领域内异军突起。至今好几篇整形论文有关报道了在繁多细菌感染性症状的各种动物模型工具中接受衣康酸或其物理修饰语ip产业物技术的方法益处,存在觉其存在靶点。相关衣康酸的“上一世”与“今生今世”,详细推书《乳酸的奋斗史周围人——衣康酸!本文一起去流浪认知衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用装饰淀粉酶组学产品,实现1000+玄之又玄度表达位点排除,平衡重演传统靶点,全定位生信研究分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“校验”全标准流程服务管理,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、科学试验工艺流程

02、试验数据报告

03、经“点”再现

在评测数据统计中,检测出许多论文参考文献中简讯的金典靶点各种衣康酸表达位点,如独另一个被发现的衣康酸共价表达核核蛋白酶KEAP1,另外 糖酵解径路中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,各种炎性小体成分核核蛋白酶NLRP3和癌细胞细胞坏死时中的要点核核蛋白酶RIPK3等,其质谱图如下图如下图如下。

04、车辆优缺点

1.多沉质控

商业性的化特异形测试探针孵育、SDS-PAGE的检查测量、WB安全验证、子样本关联性讲解等各种位的检查测量,加强组织领导楼盘可是稳定性。

2.高特点质谱实验室设备软件

在Orbitrap Astral全新这一代高辨别质谱仪扶持下,保证 衣康碱化掩盖位点及球蛋白检验新角度,肋力科学探讨探讨新看到。

3.全的流程一坐式的服务

应用于拜谱动物改进的调查软件平台,可展示“细胞系培养出来→测试探针孵育→WB探测→举重若轻度衣康过酸体现探测→专业生信阐述→其他位点PRM验证通过”全工作流程服务性,省时省钱更省事。

05、分析一下内部(部门)

06、技术应用方向盘

PART 2、医学文献分享视频

参考文献一

日文微信标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

2英文宝贝标题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

实验游戏内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

期刊论文二

用英文怎么说副标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版微信标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

调查网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、例子随之出现基本思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13极具更强的底物融合力量,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物体衣康碱化绘制组测试资料资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应修饰语(以下的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

对于TCA嵌套循环中的里面消化吸收物,衣康酸调结消化吸收、免役性和感染两者之间的彼此之间不良反应,为治療免役性感染性妇科妇科疾病给予了换用治療机制。衣康酸设备构造设计中的亲电性α,β-不饱合羧酸设备构造设计能对核高淀粉酶上的活性酶类半胱氨酸残基使用烷基化掩盖(迈克尔暴击伤害不良反应),这一项翻译资料后掩盖被喻为“衣康酸掩盖(itaconation)”,接着引响核高淀粉酶工作,管控免役性对答和消化吸收前提条件,为好几种妇科妇科疾病肿瘤药物研发部给予新想法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用表达核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究任何时候定量分析靶向治疗产生组(QMT1000)或养分分解靶向药物分解组新产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参阅专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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