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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T神经元才能快速精确肿癌神经元外层的最最通常的进行机构相匹配性组合体(MHC)呈递的抗原而晕人免疫检测抗体力发应。MHC I类(MHC-I)碳原子与CD8+ T神经元主动功能,其呈递的肽最最通常的来于于内源性胞质核蛋白质酶的核蛋白质酶酶体分解,而MHC II类(MHC-II)碳原子最最通常的形容于专业技术抗原提呈神经元,与CD4+ T神经元主动功能,其呈递的肽来于进行内体路线分解的胞外和胞内核蛋白质酶(图1)。所以说,快速精确由MHC碳原子呈递的肿癌抗原相对 设汁根据T神经元快速精确和毒杀肿癌神经元的有效性和安全防护的肺部肿瘤免疫检测抗体力的治疗方法是至关极为重要的。依据质谱(MS)的免疫检测抗体力肽组学(Immunopeptidomics)才能从多种不同神经元系、肿癌进行机构和身体健康进行机构中mtk量、间接签定MHC构建肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原聚集MHC以及其搭配肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫系统肽队列与泰语翻译后表达的信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo上上下下测序科技,不依赖现有数据库,更多通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且充沛的数据统计分折知识为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递癌症抗原的手段

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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典例阐述

01 工作机制研究分析

原创文章题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

先生发表月刊:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一个种核输入蛋白酶,在癌症复发中常常过表示,做以为癌肿发生的的能够基本要素。现有,靶向疗法XPO1的小大分子正被当做诊疗治疗癌症中成药。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫力肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一些起源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 癌肿-免疫系统进行治疗

篇文章题型:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发表文章异物:Nature Communications IF:16.6 2023

恶劣胸膜间皮瘤(MPM)有的是种愈后无良的入侵性良性肿瘤。考虑到主要的进行方法情况报告匮乏效用,对此急切需要需要新的进行方法方案。长期以来其T细胞系浸润性,小说家猜测MPM有的是个适用的进行方法性癌症复发预苗的目标值。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用针对质谱的免疫抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶意胸膜间皮瘤免疫性肽组学测量

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 细菌病毒mRNA预防针搭建

论文题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

展现报纸:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过立于质谱的天然免疫肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌皮肤感染的Hela组织上皮细胞和HCT-116组织上皮细胞中鉴别MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱工作小结

抗体检测肽组学是核苷酸质组学的一些快捷成长 的派系,它细心于研发抗体检测装置中由主耍团体相溶性包覆体(MHC)或人类白神经元抗原(HLA)氧分子呈递的抗体检测肽。这抗体检测肽是神经元界面呈递的肽段,就够被T神经元识別,若想驱散抗体检测身理反应。根据质谱的抗体检测肽组学都已经 当上亲子鉴定会MHC核苷酸呈递肽的金条件方式方法,就够可以直接亲子鉴定会各种身理和病理学阶段下各种团体和神经元类中的抗体检测肽组,举个例子企业瘤或电脑病毒患上的神经元。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的蛋清组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的天然免疫肽组检测工具服务性,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,可能正确且可以直接提供了免疫抗体性肽字段,遇到更加多非举例免疫抗体性肽,自上而下需求出稳定新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

参考使用资料

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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