草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿机系统的最经种类的皮肤疾病其一。肾组识中CaOx晶胞过饱满积聚会造成肾小管体细胞破损和凋亡，可以造成肾结石的组成。短链碳水化合物酸由肠管内生物滤池菌类进行发酵饮食纤维板生产，不仅能在位置肠管第一道防线中更好地引领的的影响，还有就是在机系统的品质上也更好地引领关键因素的的影响。但其中，丁酸是最充足的短链碳水化合物酸，兼有抗感染和抗体可以抑制的的影响,本科研探究丁酸对CaOx肾结石的的的影响以至于内在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山的医院泌尿五官科吴忠讲解、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网咯药剂学学功能，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

本文名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 用户单位名称：华山医院科室 论述目标：大鼠、HK-2受损细胞 分组进行图片信息：对应组（Con）、三维模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱作为技术应用：手机网络药理学学测量

要点流量图

研究方案最后

学习人工一方面引入大鼠类别，完成顺利生化模式指标体系和组织性方面的问题学固色等学习有效途径会发现丁酸能减掉CaOx类别大鼠肾CaOx氯化钠晶体的组成和板材损害，可以改善CaOx类别大鼠的真菌感染板材损害和氧化物反应类物质的过度紧张表现。不仅如此，丁酸还可减弱草酸诱发的HK-2肿瘤细胞系板材损害、氧化物反应应激性和肿瘤细胞系凋亡。 为探求丁酸结构类型类型和靶什么是什么是dna组互联网大数剧，完成浅析职工从PubChem更改丁酸和丁酸酯的二维和三维立体结构类型类型（图1A）。可以通过PharmMapper大数剧和Uniprot大数剧治理后共选择出117个丁酸靶什么是什么是dna组供拓宽渠道一个脚印完成浅析。将什么是什么是dna组数据显示库导进STRING大数剧，完成PPI互联网大数剧完成浅析。Cytoscape明确了顺序排列的前20的联络线靶什么是什么是dna组的具体互联网大数剧图，比如CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。哪些联络线什么是什么是dna组与互联网大数剧中的同一什么是什么是dna组均体现出有一定的涉及到性，说明怎么写哪些什么是什么是dna组会产生着推进系统。GO和KEGG完成浅析阐释了丁酸联络线什么是什么是dna组的涉及到前提条件和海洋生理学系统（图1C）。联络线什么是什么是dna组首要与类固醇皮质激素药回复、被被氧化应激化学反应反應回复、特异性酶类氧受损细胞对类固醇皮质激素药刺激到的反應与对呈酸性生物工程学元素的反應有关于。综合上面的所论，哪些联络线什么是什么是dna组首要直接参与了被被氧化应激化学反应反應和对特异性酶类氧的海洋生物工程反應操作过程，是肾结石生成逻辑中至关必要的前提条件，这揭示丁酸会在肾结石中产生必要系统。

图1| 丁酸结构的与靶遗传基因网阐述(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一大步经历丁酸对CaOx肾结石实际上切靶表观遗传，论述探讨解析技术工人根据GEO数剧库对GSE73680中身体健康较与CaOx肾结石我们的表观遗传不一致性判断了论述探讨解析。较组与CaOx结石我们的对应系数性不一致性展现表观遗传（DEGs）淘汰的标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共淘汰到3783个表观遗传發生对应系数變化，但其中3379个（89.4%）表观遗传展现调整，404个（10.6%）表观遗传展现下降（图2A）。对DEGs判断聚类算法解析解析，热图提示了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类算法解析基本特征（图2B）。随后不久，论述探讨解析技术工人凭借GeneCards数剧库人工控制判定了370个可以与CaOx肾结石对应的表观遗传，排名榜前20位的予测表观遗传极其对应性评分标准如图甲表达2C表达。为了能找到了丁酸的治疗CaOx肾结石的根本靶点，论述探讨解析技术工人将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石对应表观遗传处里能够得到一堆个Venn图。最中，CYP2C9被判断为丁酸后果CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。还有，论述探讨解析技术工人还判断了丁酸与CYP2C9的碳原子接入，CYP2C9的这三个氨基酸等残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互之间效用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在再生利用线上药学学分折CYP2C9是丁酸导致CaOx肾结石的靶表观遗传后，科学研究者还确认组织核实验设计印证了CYP2C9可拉低草酸诱导型的HK-2组织核的ROS水准、感染受伤和凋亡。

图2| 大多数据库共同深入分析估计CYP2C9是丁酸影响于CaOx肾结石的靶DNA

调查效果

本探究关键在于发展丁酸在身体之外和身上均能调控CaOx肾结石建模方法的脱色应激反应反应和宫颈感染受损，那么顺利使用数据网络数据药学学学选择取得丁酸后果CaOx肾结石的不确定性靶点——CYP2C9，第四顺利使用组织进行实验灵魂存在CYP2C9在草酸盐成脂的HK-2组织ROS工艺水平、宫颈感染受损和凋亡。这种发展显示丁酸可能顺利使用调控CYP2C9来调控CaOx肾结石的脱色应激反应反应，降低宫颈感染受损。这一项过程中中拜谱生物能力体提供了了数据网络数据药学学学工艺业务，再者拜谱生物能力体可延长成熟期落实的表观遗传组学、蛋白酶质组学、分解代谢组学等两组学货品及工艺业务，祝贺致电的方式网络咨询！ 基准论文资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.