
近日,合肥医科综合大学首要加盟三甲医院王学浩教授团体在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点消耗的能量代谢率检测分析服务。
用英文怎么说问题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名字大标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
客企业单位:南京医科大学
调查原材料:细胞
拜谱打造服务项目:转录组测序+核蛋白互作组+靶向药物能量是什么排泄组
技术应用自驾线路:
研发最后
01、YBX1被检验为HCC中糖酵解的最为关键的基因遗传
本實驗抓取HCC良性肿癌样版(n=7)的单团队团队RNA测序统计数据统计集来进行了解,得知糖酵解亲水性核心聚焦在良性肿癌团队团队中,hdWGCNA了解辨别出9个表观遗传传感器(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的长期生存模式了解决定YBX1为独立自主长期生存模式分险原因(图1H)。进两步通过IHC、WB實驗和良性肿癌团队与挨近非良性肿癌团队的位置转录组学统计数据统计集印证YBX1是肝团队团队癌诊治的暗藏靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为自动调节HCC肿瘤细胞糖酵解的重要性基本要素
02、YBX1提高HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法动能代谢率组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1有利于HCC中的有氧糖酵解和繁衍
03、OGT与YBX1整合并提高YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1综合并利于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化提升其磷碱化,最后促进会其核转位
进的一歩查测YBX1的O-GlcNAc糖基化可否导致其磷过酸,在OGT敲低的HCC癌细胞核中或用OGT限中药制剂OSMI-1处里,YBX1蛋清酶质的情况同质性缩减,YBX1磷过酸同质性缩减(图4A-C)。IP研究呈现,在同的Flag-YBX1底物的情况下,YBX1-WT的磷过酸的情况同质性远远超出YBX1-T57A,反映磷过酸的增多不只是仅是可能越来越高的YBX1蛋清酶质呈现(图4D)。剥离了核和质成分察觉到TMG处里的HCC癌细胞核中YBX1核呈现的增高(图4E-F),进的一歩察觉到YBX1磷过酸的根本调低指数公式是AKT(图4G-I)。这一些察觉到着重于O-GlcNAc糖基化确认增进其磷过酸来推进YBX1蛋清酶质可靠性并增进核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 掩盖有益于于其进每一步发生磷过酸掩盖并才能增进其核转位
05、YBX1有利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1加快PKM2转录
06、YBX1 够的提升组淀粉酶乳硝化作用修饰语水平面
研究探讨遇到YBX1敲低明显降底核蛋清乳过酸,十分是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解促使剂2-DG的实验操作可确认了糖酵解与组核蛋清乳过酸的会直观关联性,促使糖酵解可明显降底H3K18la品质(图6D)。PKM2过展现可逆转转YBX1敲低形成的H3K18la回落,以外源乳酸除理并不是不断提升H3K18la,还周期性YBX1展现调整,显示发生单向评议(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la实现丰度于YBX1重新启动子会直观促进会其转录,该操作过程受O-GlcNAc糖基化干预(图6H-J),并遇到P300 调整是YBX1增強H3K18乳酰化成用的机能(图6K-L)。
图6.YBX1明显增强H3K18乳过酸淡化级别
好文章个人心得体会
在这些探究中新闻稿了YBX1在HCC中高传达,然后与糖酵解析切相应内容。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,关键在于比较稳定淀粉酶质并增高其传达。在这种突显还提高网站YBX1在T57处的磷过酸,提高网站其核易位。从而,这个的过程明显增强了糖酵解相应内容人类dna的转录并的刺激乳酸的所产生。与此同时,YBX1解锁P300的转录,而使驱动下载组淀粉酶的乳过酸,独特是H3K18la,H3K18乳过酸单向调空YBX1人类dna转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观隐性基因正负极馈环共识机制图
拜谱总结ppt
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物制品为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶点热量基础代谢组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋清组学、翻譯后绘制组学、排泄组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
学习论文资料
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.