在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

探析结局

1、从光敏训练細胞中导入DNA化学交联氨基酸质

关键在于隔离光化学化学化学交连胆固醇质-DNA塑料物用在LC-MS分折，原作者开拓半个种性质发生变化纯化方案设计，可从DNA中弄掉非你化学化学化学交连胆固醇质，仅在的照射时用间接dna组交往丰度DNA化学化学化学交连胆固醇质。用TRIZOL导入染色法质并弄掉执行死刑获的非化学化学化学交连胆固醇，并且将其从新溶解性以来进行RNase转化。用超声心动图截取个人所得胆固醇质化学化学化学交连DNA的导入物，在硫氰酸胍中高温性质发生变化，并在二防氧化硅离心式柱上急剧洗衣以弄掉非你化学化学化学交连胆固醇质一直到完全。用核酸酶操作从DNA中脱离光化学化学化学交连胆固醇，并来进行胰胆固醇酶转化用在LC-MS分折。该做法排序为胆固醇质化学化学化学交连DNA导入或XDNAX。

图1.胆固醇质热塑DNA领取或XDNAX步骤图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可简单接触的面积DNA的氨基酸质图谱

将光热塑办法适用于MCF7内部，察觉到了1,805种得票率血清，在这当中1,191种有着于3个或更加多次重新中。60%的DNA主动效果组携带核酸整合的GO引用，在缺失核酸整合引用的血清质中，明显的影响力产于核纤层血清，后者是参与活动着色质组织化和内部裂变的血清质（图2）。

图2 . 可之间接触性 DNA 的淀粉酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3总结范文了DNA彼此功能组所潜在的淀粉酶质-DNA页面简答带有的核苷酸交连肽。这涵盖是可能（1）球状DNA相配合组成域、（2）DNA 相配合无章区（IDR）和（3）是可能与任何淀粉酶质（举例子组淀粉酶相配合淀粉酶）、RNA（举例子剪接系数）或相脱离区室（举例子核仁淀粉酶）彼此功能而会造成的学习环境达到。

图3 . 可随便碰触 DNA的设备构造域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、酶联免疫法细胞膜扰动期内与DNA切合的转录指数公式

性刺皮质激素类多巴胺受体α（ESR1）驻停留在胞质溶胶中，等你碰上其配体，引起易位到体生殖细胞膜，在在哪里它与基因组组中的相应空间紧密结合以促活相应的转录小程序。将血清饥饿的MCF7体生殖细胞膜被暴露于高摄入量性刺皮质激素类（10 nM 17β-雌二醇）4两分钟的英文，与摸拟处里的对比体生殖细胞膜相当因此的DNA双方能力组（图4A）。各举，性刺皮质激素类刺激到后DNA双方能力组中的ESR1加剧了30倍（图4B）。总得来说一，在1,814个化学发光法的球蛋清-DNA双方能力中，约有9%提示出高达2倍的相关性波动，并仔细观察到与ESR1拥有双方能力的球蛋清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌肾上腺素加工乳腺癌癌人体细胞 DNA 互为效应组的降钙素原检测相对比较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

调查进人遗传dna组的高血清酶酶质以知道它是怎么样去 被导出并付诸活动的，很久是教学科研工人一款经常性的追求幸福。遗传dna组可及性主耍以DNA为咨询中心的方面进行调查，虽然，到到目前到止到止，染色法质凝胶的用途中的什么高血清酶酶质与DNA 出现物理防御共同用途尚不明白。运行零相应光化学交联，可会发现DNA共同用途组中的大部分数高血清酶酶质，XDNAX工艺将看作高血清酶酶质-DNA共同用途调查的強大方法。

拜谱总结ppt

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的血清质组学、修饰语组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

关联性专著：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.