
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物学 为其提供 TMT蛋白酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
研发导致
实验人士研究性发生变化冷冻时扩大羊肉的硬性、持水、光泽度、分散铁含铁、ROS、脂质过防化合物、MDA、GSH和GPX4级别来鉴定肩部肌肉机构体上皮细胞的铁消亡心态。没想到现示,冷冻时扩大后,羊肉的硬性在第四天和第6天有明显变低;持水水平减少;本色变深,消失光泽度,鲜朱蓝色转成暗朱蓝色。不但,分散铁、生物氧和MDA的含铁有明显扩大,体上皮细胞凋亡率有明显上升。 研究方案人士分离出多种冷冻时候的脂肪原材料的核膳食纤维,后来做好SDS-PAGE具体研究分析,核膳食纤维条带在多种期区域不均且相近(图1a)。随着核淀粉酶在多种原材料中的形容事情,具体研究分析表明同个组原材料的中个数相当于同个水准(图1b),证明脂肪原材料核膳食纤维具备有充分的组内相近性和组间相互影响性。 球蛋清酶酶质组学共检测结论出1996种球蛋清酶酶质。以B0为对应组,需求B1、B2、B4和B6中的球蛋清酶酶实施对比剖析体现出剖析,共检测结论到37七个DEPs。将火山图交互,并会按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两规则剖析DEP。结论如下图图示1c-f图示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检测结论出22、33、73和140个DEPs,其中的分刘海别上浮6、11、32和8九个,调整16、22、41和55个。聚类分析措施考评了不同的冷库一阶段腿部相关肌肉公司中球蛋清酶酶质的体现出,结论表示腿部相关肌肉球蛋清酶酶体现出对比剖析逐渐补充期限的加剧而加剧(图1g)。
图1| 其他冷冻的时间的身体肌肉产品的样品核苷酸质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 的不同冷藏箱的时间的肩部肌肉印刷品差别蛋白酶探讨(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁窒息死亡淀粉酶肽的PRM降钙素原检测深入分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 鉴于KEGG聚集相互影响表示蛋白质的铁去世规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生态学提供了TMT化学发光法蛋清质组学高技术设备于,拜谱微生物已研发培训已完成并创建了逐步完善成孰的转录组学、蛋清组学、代谢率组学各类两组学协力物品高技术设备于指标体系,欢迎致电咨询!
可以参考论文资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.